Do dana današnjeg ne postoji lijek za FMD. No, FMD se može adekvatno zbrinjavati s ciljem smanjivanja simptoma i sprječavanja komplikacija.

Lijekovi kao što su antihipertenzivi se mogu propisati u slučaju FMD bubrežnih arterija koja uzrokuje hipertenziju. Lijekovi koji razrjeđuju krv, u obliku niskodoznog aspirina (acetilsalicilne kiseline) se također mogu preporučiti, pogotovo u slučaju multifokalne FMD, ili FMD arterija glave i vrata.

Mnogi pacijenti s FMD pate od glavobolja, često migrena (koje mogu biti pulsirajućeg karaktera) koje se liječe lijekovima protiv bolova po potrebi, ili antimigrenskom terapijom. Neki antihipertenzivi kao što su beta blokatori mogu ublažiti glavobolje.

Vazokonstriktori kao što su ergotamin i triptani su u principu kontraindicirani (zabranjeni) u pacijenata s FMD.

S obzirom na moguću ulogu duhana u progresiji FMD, prestanak pušenja je strogo preporučen.

U slučaju teške stenoze bubrežnih arterija povezane s FMD kao uzroka arterijske hipertenzije, ili drugih simptoma povezanih sa smanjenim protokom krvi kroz bubreg, perkutana angioplastika može biti predložena, radi dilatacije arterije s balonskim kateterom i stvaranja prohodnosti stenoze/suženja. Ovo se obično radi tijekom angiografije koja omogućuje potvrdu dijagnoze FMD. Uska cijev (kateter) se uvodi u arteriju, najčešće kroz femoralnu arteriju (prepona), a zatim se napuše balon kako bi se suženje otvorilo i učinilo prohodnim za bolji protok krvi. Stentiranje obično nije potrebno, zapravo nije niti preporučeno zbog slučajeva blokiranja stenta trombom (krvnim ugruškom), a i prijelomi stenta su bili prijavljivani. Ali stent može biti potreban u rjeđim slučajevima kad dolazi do razdora tj. disekcije arterije ili u drugim specifičnim situacijama. Nakon angioplastike, trebao bi proći period bolničkog praćenja od barem 24 sata. U slučaju pridružene aneurizme, FMD u malim arterijskim ograncima ili ponavljanih neuspjelih angioplastika, klasična kirurška procedura može biti nužna.

U slučaju moždanih aneurizma, opcije uključuju redovno praćenje metodama slikovnog prikaza ili endovaskularno liječenje s coilingom (zavojnice) ili stentom, ili čak klasičnu otvorenu kirurgiju. Liječenje ovisi o faktorima rizika i dobi pacijenta, isto kao i o mjestu i veličini aneurizme.

Općenito, liječenje FMD će ovisiti o simptomima i kliničkoj slici bolesti, isto tako i težini, lokalizaciji i opsegu arterijskih lezija. Liječenje/zbrinjavanje FMD bi se trebalo dogovarati sa specijalistom koji se uže bavi FMD, najbolje unutar multidisciplinarnog tima.